Salário líquido é o que cai na conta do empregado depois de descontados do salário bruto o INSS, o imposto de renda e outros descontos, como vale-transporte, plano de saúde ou pensão alimentícia.
O FGTS não entra nessa conta: é depositado pela empresa e não sai do salário.
Exemplo com dado do site
Com salário bruto de R$ 5.000,00, sem dependentes, o INSS é de R$ 501,51, o imposto de renda é de R$ 0,00 e o salário líquido é de R$ 4.498,49.